どんな蛍光化学物質がほしい?~蛍光タンパク質と蛍光化学物質の棲み分け~ - Togetter
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> どんな蛍光化学物質がほしい?~蛍光タンパク質と..
2010/08/15 11:39:49
+
どんな蛍光化学物質がほしい?~蛍光タンパク質と蛍光化学物質の棲み分け~
生物学研究に蛍光化学物質を使う、とは。
蛍光蛋白質と蛍光化学物質それぞれの長所、化学物質に求めることなどを妄想混じりで語っています。
いつの日か、現在不可視のものが可視化できることを願って・・・
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Fm7
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【緩募:生物屋さんへ】蛍光タンパク質によるライブイメージングが全盛期の今、
化学物質を使ったイメジーングにしかない長所は何か。
また
どんな化学物質があると嬉しいか。
#Sci_on
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mdr52
2010/08/15 11:15:05
やはり細胞内の特異的蛋白質を化学物質で染めるのは抗原-抗体反応もしくはAvidin-Biotinなどを使わないと難しいわけで。そうなると融合蛋白質として発現させる事ができる蛍光蛋白質は非常に強いわけです。
#Sci_on
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mdr52
2010/08/15 11:34:47
そうなると細胞小器官や、Ca2+などのセカンドメッセンジャーを見る事に化学物質は非常に有用であるかもしれない。でも例えば
細胞内Ca2+を見るならばFura2などのカルシウムインジケーターをAM体にしたものがある
わけです。
http://bit.ly/9CuUp0
#Sci_on
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mdr52
2010/08/15 11:35:53
また
膜器官を見るならばFM1-43などのdyeがすでにある
わけで・・・。
http://bit.ly/akp9Lm
というわけでこれらでは見れないような化学物質を使った生細胞イメージング、これらの不満点を募集したいわけです
#Sci_on
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mdr52
2010/08/15 11:36:15
最近便利そうだなと思うのがPKHと言う脂質リンカーが付加した色素
。
使っている方いませんか?
#Sci_on
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raota
2010/08/15 11:45:55
若干内容が専門的な気もするが、僕のTLには色素屋さんが多いので。生物屋から求めている物がわかればいいなあと。
#Sci_on
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mdr52
2010/08/15 11:36:37
@mdr52
逆に、生物屋は蛍光タンパク質、化学物質の情報をよく知らない。何ができて、何が出来ないのか、がわからないので、こんなことできたらいいなぁ〜っていうのも現実味がない。と感じています。私はイメージング好きなので、多少は勉強しましたが、専門知識には乏しいです。
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KiMmye_O
2010/08/15 11:43:28
@mdr52
ただし、融合タンパク質として発現させること自体、かなりのリスクがあると考えています。誰でも思いつくでしょうが。>融合蛋白質として発現させる事ができる蛍光蛋白質は非常に強いわけです。
#Sci_on
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KiMmye_O
2010/08/15 11:45:11
@mdr52
ケミカルの方が褪色少ない・しないってものが選べるのは長所かと。短所は特異性と毒性。つまり、これがクリアできれば嬉しい。
#Sci_on
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cytometrer
2010/08/15 11:28:38
@mdr52
利点は投与量が制御可能なこと。低毒性で染め斑が出難く、定量性が確保されていれば理想的。
(引用編集済) RT 【緩募:生物屋さんへ】蛍光蛋白質による生体撮像法全盛の今、蛍光試薬利用の撮像法にしかない長所は?&どんな蛍光試薬があると嬉しい?
#Sci_on
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yokodon001
2010/08/16 15:03:42
化学物質しか使ったことないのですが。。nativeなタンパク質を検出可能なことですかね?コスト面ってのも思いついたのですが、、どっちが低コストなんでしょう??>化学物質を使ったイメジーングにしかない長所は何か。
#Sci_on
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oikomiuma
2010/08/15 12:18:43
パルスラベル
。
RT
@mdr52
【緩募:生物屋さんへ】略 化学物質を使ったイメジーングにしかない長所は何か。略
#Sci_on
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Usugiri_Baum
2010/08/15 12:42:04
蛍光性小分子のメリットとしてすぐに思いつくのは、蛍光タンパクに比べて、輝度が高い・光安定性が高い(褪色が遅い)・foldingやmaturationのための時間が必要ない
、あたりでしょうか・・・。
@mdr52
#Sci_on
[from Philly]
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poccopen
2010/08/15 12:53:07
蛍光タンパク質って、開発が進んでblueからfar redまで、いろんな色が作られてきましたが、励起・蛍光スペクトルが割とブロードなので、同時に使える種類数が限られちゃうんですよねぇ。
もしスペクトルがよりシャープなケミカルが作れるなら・・・。
#Sci_on
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poccopen
2010/08/15 14:47:01
スペクトルがシャープな蛍光物質が他種類あっても、各々に対応した励起光をどうやって用意するか、という問題は残りますよねぇ。半導体レーザの波長は可変じゃないですし、波長域の狭いバンドパスフィルタをたくさん搭載っていうのもたいへんですよねぇ。
#Sci_on
[from Philly]
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poccopen
2010/08/15 14:50:38
蛍光化学物質だからこそできること・・・。
例えば、マラカイトグリーンはRNAアプタマーに結合することで蛍光強度が約3桁増大するのですが、蛍光タンパク質ではこのような「特定の条件下でのみ蛍光を発する」性質を持たせることがかなり困難ですね。
#Sci_on
[from Philly]
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poccopen
2010/08/15 15:15:39
@mdr52
SNAP-tagやCLIP-tagによる可視化(非蛍光性タンパク質タグ+蛍光性小分子)っていうのは邪道でしょうか?
http://www.nebj.jp/f/48
SNAP-tagユーザーさんのご意見が知りたかったりします。
#Sci_on
[from Philly]
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poccopen
2010/08/15 12:28:45
タグつけて蛍光標識もありだと思いますが、そうすると既存の蛍光色素に踏みいる隙がないような気がします。なにか蛍光タンパクを大きく超えるメリットはあるのでしょうか
@poccopen
#Sci_on
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mdr52
2010/08/15 12:40:00
標識となると、標識効率という問題が悩ましいですね… RT
@poccopen
: 蛍光性小分子のメリットとしてすぐに思いつくのは、蛍光タンパクに比べて、輝度が高い・光安定性が高い・foldingやmaturationのための時間が必要ない、あたりでしょうか・・・。
#Sci_on
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mdr52
2010/08/15 13:04:39
@mdr52
蛍光タンパク質より分子量の小さいタンパク質の局在、動態が調べられる可能性がある。
すっごい小さいものにもラベルできる化学物質があるといいな。
薬にもラベルできれば薬物動態が見れるかな。
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kikukawatoei
2010/08/15 14:59:03
うーむ、やはり蛍光タンパクと比べて小分子と言う意見が圧倒的多数。しかしそれなら既存の物質でだいたいOKなわけですよね。もっと新しい現象に迫る蛍光化学物質の使い道はないでしょうか。
#Sci_on
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mdr52
2010/08/15 15:06:34
@mdr52
新しい現象、難しいですね。わかりません。蛍光タンパクでも色素でもいいので、
相互作用する相手を次から次へとラベルしてくれるものがあればいいです。
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kikukawatoei
2010/08/15 15:33:01
「もしなんでも見えるとしたらなにが見たいのか」
、くらいでも嬉しいです。意外と既存の化学物質を応用すればすぐ見れるものもあったりして??
#Sci_on
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mdr52
2010/08/15 12:31:50
インジケータ、細胞外に放出された分子(明言しませんが)を細胞膜上で検出できるようなものがあったら助かるなあと。
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seek_for_color
2010/08/15 11:29:08
染色剤の方が蛍光タンパク標識よりnativeに近い状態を観察できるはず。一般的な面では特異性が高く、退色しにくいのが増えるといいな。専門だと、
固定せずにmtDNAを可視化できるのが欲しい。
DAPIやSYBR-Gは固定必要。
#Sci_on
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nisyam
2010/08/15 11:22:27
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